對鍋爐發出起動信號后，為防止點火時發生“冷爆”，先進行“預掃風”，用壓縮空氣大風量吹掃，即：油泵和風機自動起動后，把風門調到最大而不向爐膛內供油。“預掃風”結束后，進行點火操作。自動把風門關到最小位置，然后，打開點火噴油電磁閥噴入少量燃油，接通點火變壓器進行點火。如果點火成功，進入正常燃燒狀態，此時，噴油電磁閥正常打開。自動控制系統要求點火成功后自動斷開點火變壓器。

自動安全保護和自動故障報警控制對船舶燃油輔助鍋爐進行控制，不僅難度大，而且危險性很高，所以完善的安全保護和故障報警系統對于這個控制系統尤為重要。采用4位BCD碼的數碼管來顯示停爐、報警信號，即：高二位顯示故障類別，低二位顯示故障代碼。1）當發生危險低水位、高汽壓；中途故障熄火；風機失靈、電機過電流；長時間（如20s）低油壓等情況時，實施停爐，同時報警裝置發出聲光報警。2）為防止干擾信號引起誤動作，產生誤報警，系統對下列繼電器動作信號延時一定時間報警：報警高水位、低水位、高汽壓、低油溫、高油溫。3）為保證鍋爐運行的連續性，如發生工作油泵電機出現過流、工作水泵電機過電流故障等故障時，備用泵將自動啟動并取代故障泵繼續運行。4）可通過編程器調看輔鍋爐運行時間。5）管理人員要關注操作面板上的維護周期指示燈，通過它，關注鍋爐是否到達維護周期。需要注意的是：系統經過檢修維護后，管理人員一定注意按下維護周期復位開關，使PLC內部定時器清零復位，重新計時。